ご質問ありがとうございます。
CMONOS.JP のデフォルトのXHTML/CSSは Vicuna 互換ではありません。一度 CMONOS.JP を Vicuna 互換設定にするまで表示が崩れますのでご注意ください。
CMONOS.JP マニュアル:CMONOS.JP 共通:Vicuna CMS を導入したい
こちらにありますように、一度「Vicuna 互換サイトテンプレート」を適用するのが CMONOS.JP を Vicuna 互換にする最も簡単な方法です。まだコンテンツがないようですので、このマニュアルのまま実行して問題ないかと思います。
(サイトテンプレートを利用しない場合は、Vicuna 読み込み以外の default.css の記述を全て消す必要があります。)
また、ショコラ・ダーク サンプルのナビゲーション部分は、CMONOS.JP 独自のものとなっています。もし、ショコラ・ダークと同じような表示にしたい場合は「ショコラ・ダーク」サイトテンプレートを適用してください。
CMONOS.JP マニュアル:セットアップアシスタント:サイトテンプレートの導入
なお、「ホーム」など静的書き出しツールでは、「最新のテンプレートを使う」オプションを有効にして「保存」するまで、最新の設定が反映されませんのでご注意ください。
ヘッダ画像にふさわしくない画像が表示されてしまう場合は、その画像が添付されている記事を書き出したツールの環境設定を開き、フィールド設定で「メディアフィールド」を空欄にして「保存」します。
特殊フィールド「メディアフィールド」の設定は「入力フィールド設定」および「ページ情報フィールド設定」を開くと下の方にあります。
Vicuna 専用 CSS スキン読み込み後、ナビゲーションが崩れる場合は「ナビメーカー」で「ナビゲーション書き出し」を実行してください。Vicuna スキンにあわせてナビゲーション部分が調整されます。(次バージョンにこの旨注意書きを付記することにしました。ご指摘感謝いたしますm(_ _)m。)
以上参考になりましたら幸いです。