ご質問ありがとうございます。
はい、ご推察の通り、お使いのサーバに「LWP::UserAgent」と「Crypt::SSLeay」がみつからない場合、「支払い方法・送料」で、「PayPal」関連設定は表示されません。
(その点、ロリポップがどうなっているのか、少々とまどっております。)
SSHを利用可能なサーバではユーザー自身で「Crypt::SSLeay」をインストールできる場合があります。
その場合は、こちらの開発者ブログ記事がお役に立てるかもしれません。
https://cmonos.jp/blog/2009041301/1.shtml
以上参考になりましたら幸いです。
〈追記〉
次期バージョンでは、モジュールがみつからないため PayPal を利用できない旨表示するようにいたします。参考になるご指摘、ありがとうございます。何の警告もないのは、不親切に過ぎると気づかされました.