お世話になっております。ご質問ありがとうございます。返信コメントを完全に削除することはできません。
ツリー式掲示板の場合、返信コメントを前提とした別の返信コメントがつく場合があるため、書き込みの経緯を明らかにするために返信を削除できないようにしています。
記事の痕跡を明らかにすることで、ここにこのような返信があるのは削除された返信のせいだろう、とわかるようにするためです。
これは仕様です。
どうしても返信記事を削除したい場合は、その返信コメントの親記事をその返信コメント自身に変更し(親記事変更欄に当該記事番号もしくは当該記事の単記事表示URLをコピーします)、独立したスレッドとしてから、そのスレッドを削除します。この作業は返信を削除した後には行えません。
以上よろしくお願いいたします。