XREA.COMへのインストール

トップ以外のディレクトリへのインストールの件、解決したのでしょうか。

htdocsフォルダの内容をpublic_html内に、cgi-dataフォルダ以下をpublic_htmlの外にアップロードしたのですが、トップページで示されるセットアップアシスタントのuriにアクセスできません。
/cgi/setup/start.cgi?m=Tools&k=s300 にアクセスしようとすると、「404 The requested object was not found on this server.」のエラーとなります。
/cgi/setup/start.cgi にはアクセスできて、ログインできますが、パーミッション最適化ができません。
左上のメニューに、

• 消費税・カート情報変更
• サイト情報一覧
• パーミッション最適化
• パーミッション調整
• 設定終了
  があらわれません。

アップロードの失敗やtgzファイルのダウンロードの失敗の可能性を考えて、はじめからやり直してみたのですが、状況に変わりはありません。

お忙しいところ申し訳ありませんが、どうぞよろしくお願いいたします。