質問ではなくささやかですが情報提供です。
サーバーがさくらインターネットのライトプランでCMONOSをテスト設置させて頂きました。
おおむね良好に動作したのですがギャラリーを選んだ時にヘッダのトップページやニュースなどのリンク先がhttps://cmonos.jp/を見に行っていました。
原因は不明ですが/lib/xfiles/site-navi.jsが書き換わらない(?)ようです。
(そもそも自動で書き換えるモノなのか私が導入手順を飛ばしたのかすら不明ですが)
邪道と知りつつsite-navi.jsをテキストエディタで編集し、自サイトのアドレスに書き換えたところ、現在は順調に動いております。
今後設定を変更した時に何かあるかも知れませんが、とりあえずもし私と同じ症状でお悩みの方がおられましたら手助けになればと思い、書き込みさせて頂きました。
単純な内容を説明するのに読みにくい文で失礼しました。