インストールについて

初めて投稿させていただきます。
今回以下のサーバーにインストールを試みました。
サーバー：SIX CORE
jcode.pm インストール済み
文字コード EUC-JP

上記サーバーにてインストールしたところ500 Internal Server Errorが発生しました。

サーバーマニュアルにてCGIの設置場所を確認したのですが、ホームディレクトリの構成が以下のようになっており、その中であれば動作は可能とのことでした。

/home/ドメイン名/public_html/
上記がサーバーパスとなっております。

jcode.pmおよびjcodeフォルダは削除済みで、_htaccessは.htaccessに変更済みです。

利用しようと思っているのは、サブドメイン上にインストールしようと考えております。

現在の設置構成
/home/ドメイン名/public_html/search/cgi-data

cgi-dataと同じ階層にhtdocsの中身をアップロードしました。
また、アップロードの際に文字コードの変換は行っておりません。

http://○○.ドメイン名/cgi/servercheck.cgiに接続したらエラーが返ってきます。

パーミッションも指定されているディレクトリが704で、ファイルが604となっております。

分かりにくい書き方で大変申し訳ないのですが、どのようにインストールすれば良いかお教えいただければと思います。