設置ファイルについて

はじめまして。

こちらのツールを使ってみたくて、今　悪戦苦闘しながら、マニュアルとにらめっこしているのですが
初心者なため、専門用語などわからず、理解ができてない部分もあります。
cgiやphpは何度も設置経験はあるのですが…

まず、ファイルを解凍すると、CMONOS_JP_20120315フォルダの中に、４つのフォルダがありますよね

これを任意のフォルダを作成した中に、転送していたんですが…
全部、転送する必要はないんですか？

サーバーはロリポップで、インストーラーでうまく出来なかったので、FFFTPを使っています。

マニュアルやインストーラなど、とても親切な解説があるのですが
基本のポイントみたいなところを、なかなか抑えられなくて
拙い質問で、申し訳ないですが、よろしくお願いします。