Re:Chapterの構成について

ご質問ありがとうございます。いくつか方法がありそうです。

○CSS の E:nth-child(n) セレクタを使う。

参考）E:nth-child(n)－CSS3リファレンス

2番目の div.section について、2カラムとなるよう、「default.css」などにスタイルを追記します。

※IE9より前のバージョンは非対応です。

○複数 section を一つの section として、フィールドを増やす

変則的な section を含めて一つの section とし、複数 section 分フィールドを増やします。

○「<!--if id=""-->」タグを使う

1. チェックボックスなど、カラム数をコントロールするフィールドを追加します。入力した値は表示しないよう「default.css」などにスタイルを追記するか、フィールドタグをコメントタグで囲みます。
2. そのフィールドに値がある時とそうでないときでクラス名の異なる div で囲むようにします。
3. クラス名に応じカラム数が変化するよう「default.css」などにスタイルを追記します。

○新しい chapter に相当する部分を、別の「ホームページメーカーLite」で作成して、埋め込む

1. 別の「ホームページメーカーLite」をインストールして、2カラムになるよう class 名やスタイルを調整します。
2. 「<!--ssi_body--><!--/ssi_body-->」タグで埋め込み用ファイルに書き出す範囲を指定します（2カラムになっている部分）。
3. 「ページテンプレート部分を埋め込み用ファイルに書き出す」を有効にし、「埋め込みタグ(SSI)」をコピーして、埋め込み先ページテンプレートの適切な位置にペーストします。

少々ややこしいかと思いますが、以上参考になりましたら幸いですm(_ _)m。