ご返信ありがとうございます。
「ホームページメーカー」で作成した記事を「ホーム」にしたい、ということだと誤解しておりました。
「ホームページメーカー」の総合インデックスを「ホーム」にすることは難しいように思います。
「.htaccess」で「/」と「/index.shtml」を「/ホームページメーカーのフォルダ/index.shtml」にリダイレクトすると、ご希望の状態に近づくかもしれません。(リダイレクトさせると本来の「ホーム」は表示されません。)
RewriteEngine on
RewriteRule ^/(index\.shtml|)$ /ホームページメーカーのフォルダ/index.shtml [L,R=301]
ただその場合、ご指摘の通り、トピックパスの第一階層と第二階層が同じになります。これを期待通りのトピックパストするには、各カテゴリの全ページレイアウトについて、トピックパスを手書きで記述する必要があります。
<ul id="topic path">
<li class="home">
<a href="/ホームページメーカーのフォルダ/" target="_top">ホーム</a></li>
<li><a href="/ホームページメーカーのフォルダ/カテゴリ">カテゴリ1</a></li>
</li><li class="current"><!--pagetitle--><!--/pagetitle--></li>
</ul>
以上参考になりましたら幸いです。