ご連絡ありがとうございます。ご協力感謝いたします。
こちらのデータベースは1000以上のレコード数があるのでしょうか。
お使いのTableMakerでは過去の書き込みに戻れる設定になっていますので、書き込みごとに、(保存データを持つレコードの分)20-30のファイル数が増えます。すると、5回書き換えたとして、100。それが1000レコードあれば、10万にはなります。
ですので、レコード数が数千あり、書き換え回数がある程度あれば、数十万のファイル数になることはあり得そうに思います。
残念ながら、現状では過去の書き込みデータを一括削除する機能がないため、手軽にファイル数を減らすことは困難です。ただ過去の書き込みデータを削除できれば、レコード数が数千ある場合は、最大1/5程度にファイル数が減るかと思います。
ご不便をおかけいたしますが、一週間ほどいただけましたら、なんらかの過去の書き込みデータを削除するツールをご提供いたします。
ファイル数制限に関してはあまり考慮しておりませんでした。次期バージョンではこの点についても改善したく思います。情報提供、ありがとうございます。
(次期バージョンは互換性を大きく失う予定です。今年中にはと考えているのですが、スケジュールが遅れておりまして公開は未定です。)