ダウンロード販売と並行して通販

お世話になっております。

現在、Paypal決済でダウンロード販売を使用しているのですが、並行して通販もやりたい場合はどうしたらよいでしょうか？

おそらく、いまのショッピングカートはダウンロード販売専用になってしまっているので、もう一つ通販用のショッピングカートをインストールすればよいのでしょうか？

そのときPaypalのAPI証明書は同じものを使ってもよいのでしょうか？
よろしくお願い致します。